4 czerwca 2007 roku został wybrany prorektorem do spraw organizacyjnych Papieskiego Wydziału Teologicznego we Wrocławiu. 1 września 2010 roku rozpoczął swoją drugą kadencję na tym stanowisku. Poza tym wykłada w Instytucie Humanistycznym Państwowej Wyższej Szkole Zawodowej im. Angelusa Silesiusa w Wałbrzychu. 26 czerwca 2012 roku. uzyskał stopień naukowy doktora habilitowanego, a 1 października tego samego roku mianowany został profesorem Papieskiego Wydziału Teologicznego we Wrocławiu. Podczas 359. Zebrania Plenarnego Konferencji Episkopatu Polski wybrano go na konsultora Rady Naukowej KEP. 10 października 2012 roku został wybrany rektorem Papieskiego Wydziału Teologicznego we Wrocławiu.
Publikacje Kiedy myślę Polska. 100 drogowskazów Jana Pawła II dla Ojczyzny, Świdnica 2007. Przeznaczeni do głoszenia Ewangelii. Rok Świętego Pawła, Wrocław 2009. Misterium miłości, Wrocław 2010. Kształtowanie się studiów teologicznych we Wrocławiu w latach 1702-2011, Wrocław 2012.
Bibliografia
Biografia ks. Andrzeja Tomko na stronie PWT we Wrocławiu