W kaplicy św. Krzyża, znajdującej się pod posadzką, znajduje się późnobarokowy krucyfiks z połowy XVIII wieku, który został tu przeniesiony z klasztoru reformatów w Wieleniu.
Przed klasztorem na niewielkim dziedzińcu znajduje się figura św. Franciszka z Asyżu oraz pęknięty dzwon św. Franciszka i św. Jana Kapistrana odlany w 1730 roku przez poznańskich ludwisarzy, zawieszony na jednej z wież w 1733 roku a strącony w 1945 roku.
W klasztornej bibliotece znajduje się około 10 tysięcy rękopisów i starodruków, w tym 172 inkunabuły. Przy bibliotece znajduje się również niewielkie muzeum związane z misjami zawierające około 400 eksponatów etnograficznych z krajów dokąd udają się misjonarze z prowincji.
Poznańska Droga św. Franciszka W październiku 2025 r. odbyła się pierwsza wycieczka nowym szlakiem pielgrzymkowym, nazwanym Poznańską Drogą św. Franciszka. Łączy ona dwa franciszkańskie kościoły: ten na Placu Bernardyńskim z kościołem franciszkanów konwentualnych na Górze Przemysła. Szlak ten powstał dla upamiętnienia 800-lecia Pieśni słonecznej św. Franciszka oraz 10-lecia encykliki Laudato si’ papieża Franciszka w Roku Jubileuszowym 2025, by zachęcać do modlitwy o pokój. W opisie szlaku wykorzystano zadania duchowe zaproponowane wcześniej w opisie rogalińskiej Drogi Pokoju.