W pierwszych wiekach chrześcijaństwa List Klemensa włączany był niekiedy do kanonu Nowego Testamentu i często czytywany w kościołach, co potwierdzają świadectwa m.in. Dionizego z Koryntu i Euzebiusza z Cezarei.
Sam fakt napisania listu przez biskupa Rzymu do innej wspólnoty był podnoszony wśród niektórych badaczy katolickich jako argument za istnieniem już w czasie jego powstania prymatu Biskupa Rzymu. Argument ten spotkał się z polemiką protestanckąWaldemar Turek Prima Clementis: Zagadnienie prymatu biskupa Rzymu w ujęciu współczesnych opracowań patrystycznych, w: Vox Patrum, nr 24 (2004), s.33-49, nie jest także podtrzymywany w nowszej literaturze katolickiejNorbert Widok Klemens Rzymski o sukcesji apostolskiej, w: Vox Patrum, nr 34 (2014), s. 541-543. Poczynając od XVIII wieku treść i znaczenie listu było przedmiotem kontrowersji wewnątrz protestanckich, a następnie także katolicko-protestanckich, dotyczących poza prymatem Biskupa Rzymu, również początków prawa kościelnego, związku między charyzmatem i urzędem, powstawania hierarchii kościelnej i zasady sukcesji apostolskiejWaldemar Turek Bóg, w którego wierzą chrześcijanie według Prima Clementis, w: ''Vox Patrum, nr 34 (2014), s. 269.