10 września 2009 Centrum Wsparcia Teleinformatycznego i Dowodzenia Marynarki Wojennej otrzymało sztandar ufundowany przez Starostwo Powiatowe w Wejherowie, Urząd Miasta i Urząd Gminy Wejherowo. Uroczystość odbyła się na placu Jakuba Wejhera w Wejherowie, w asyście Kompanii Reprezentacyjnej i Orkiestry Reprezentacyjnej Marynarki Wojennej.
1 stycznia 2014 roku Centrum zostało podporządkowane dowódcy 9. Brygady Wsparcia Dowodzenia Dowództwa Generalnego Rodzaju Sił Zbrojnych.
W 2014 roku Centrum zostało rozformowane, a na jego bazie utworzono: batalion dowodzenia MW w Wejherowie, podporządkowany dowódcy 9. Brygady Wsparcia Dowodzenia DG RSZ, 18 Wojskowy Oddział Gospodarczy w Wejherowie, podporządkowany bezpośrednio Inspektoratowi Wsparcia Sił Zbrojnych w Bydgoszczy, Zespół Zarządzania Wsparciem Teleinformatycznym w Gdyni, podporządkowany szefowi Inspektoratu Systemów Informacyjnych.
Struktura komenda CWTiD MW; Oddział Łączności i Obserwacji; Oddział Informatyki; Rejon Zabezpieczenia Teleinformatycznego Zachód; Rejon Zabezpieczenia