Pod koniec swojego istnienia, gry był sprzedawane po bardzo niskich cenach wraz z darmowym Power Base Converter - urządzeniem pozwalającym na uruchamianie 8-bitowych gier na Mega Drive. Wszystko za sprawą przedsiębiorstwa Bobmark International, które w 1996 roku przejęło od Nissho Iwai obowiązki dystrybutora.
Japonia i inne regiony thumb|220px|Master System Girl, przenośna wersja urządzenia wydana w Brazylii z myślą o kobietach Choć pierwowzór konsoli, czyli SG-1000 Mark III był sprzedawany na rynku japońskim, to w październiku 1987 roku Sega zdecydowała się wydać konsolę ponownie z zachodnią architekturą. Model ten był również porażką a jej udział na lokalnym rynku szacowano na 10%.
Poza Europą Zachodnią, system radził sobie równie dobrze w niektórych mniejszych regionach. W Korei Południowej dystrybutor Samsung, który ze względu na ograniczenia importowe wydał konsolę pod nazwami "Gam*Boy" i "Aladdin Boy" sprzedał 720 000 sztuk aż do 1993, nazywając ją najlepiej sprzedającą się konsolą 8-bitową w kraju. Dobre wyniki notowano również w Australii oraz Nowej Zelandii, gdzie NES zaczął być liczącą się platformą dopiero od 1993 roku. Największy sukces Master System zdobył w Brazylii, gdzie dystrybutorem było lokalne przedsiębiorstwo Tec Toy od 1988 roku, posiadając w latach 80. i 90. od 75% do 80% rynku 8-bitowego.