Latem 2009 Aguilar został zawodnikiem meksykańskiego zespołu San Luis FC z siedzibą w mieście San Luis Potosí. Tam od razu został podstawowym stoperem drużyny, w meksykańskiej Primera División debiutując 9 sierpnia w przegranej 1:2 konfrontacji z Morelią, natomiast pierwszego gola strzelił 20 września w przegranym 2:4 meczu z Cruz Azul. Po upływie roku na zasadzie wypożyczenia zasilił argentyński Arsenal de Sarandí, gdzie również spędził dwanaście miesięcy bez poważniejszych osiągnięć. W styczniu 2012 został wypożyczony ponownie, tym razem do swojego macierzystego Sportivo Luqueño, którego barwy reprezentował przez kolejne pół roku, mając pewne miejsce na środku defensywy. W późniejszym czasie, również na zasadzie rocznego wypożyczenia, przeniósł się do meksykańskiej ekipy Club Tijuana. Tam stworzył solidny duet stoperów z Javierem Gandolfim i w jesiennym sezonie Apertura 2012 zdobył ze swoją drużyną prowadzoną przez Antonio Mohameda pierwsze w historii klubu mistrzostwo Meksyku. Dzięki świetnym występom w 2012 otrzymał nagrodę dla piłkarza roku w Paragwaju, a także został wykupiony przez Tijuanę na stałe.