Biskup miał zignorować zalecenie o obraniu tradycyjnej drogi od południa przez Jezioro Wiktorii. W latach 1885–1887 wskutek prześladowań z rozkazu Mwangi zginęło m.in. 45 chrześcijan katolickich i protestanckich, uznanych później za męczenników wiaryInne źródła podają rok 1882 kiedy to 32 osoby zostały spalone w Namugongo, 51 zostało zabitych w stolicy a ok. sto zginęło podczas dalszych prześladowań, patrz Gates (2012). Britannica (2013) mówi o 3 ofiarach w 1885 roku i 30 w 1886 roku. Britannica (2016) podaje, że 22 zamordowanych katolików zostało uznanych przez Kościół katolicki za męczenników wiary i kanonizowanych przez papieża Pawła VI 18 października 1964 roku..
10 września 1888 roku szefowie (bakungu) wymówili królowi posłuszeństwo i wygnali go z kraju. Doszło do kolejnej wojny domowej. W październiku 1888 roku muzułmanie dokonali zamachu stanu, po czym chrześcijanie wraz z Apolo Kagwą przywrócili Mwangiego na tron w październiku 1889 roku, a Kagwa został premierem – katikiro, nabywając coraz więcej władzy w królestwieInne źródła podają rok 1890, patrz Britannica (2008).. Interwencje niemieckich i brytyjskich agentów przyczyniły się do zwycięstwa frakcji protestanckiej nad katolicką i do dalszego umocnienia pozycji Kagwy.