Troughton po opuszczeniu serialu powrócił do niego gościnnie jeszcze trzy razy. W 1973 roku wystąpił u boku Jona Pertwee i Williama Hartnella w historii The Three Doctors, która została specjalnie napisana na uczczenie 10-lecia istnienia serialu. 10 lat później, w 1983 roku na wniosek ówczesnego producenta serialu, Johna Nathana-Turnera, zgodził pojawić się w historii pt. The Five Doctors na 20-lecie Doktora Who wraz z wieloma innymi aktorami występującymi na przestrzeni lat w serialu. Pojawił się również na konwencie połączonymi z uroczystościami rocznicowymi w Longleat. Troughton cieszył się z powrotu do programu, tak bardzo, że zgodził się na kolejny powrót w 1985 roku w historii The Two Doctors.
W związku z pięćdziesiątnicą serialu Doktor Who, w 2013 roku wyemitowano specjalny dramat dokumentalny pt. An Adventure in Space and Time opisujący początki istnienia serialu. Wśród postaci w filmie występuje również Patrick Troughton, którego gra Reece Shearsmith.