Przez miasto przebiega też dwutorowa linia kolejowa nr 210 (Chojnice – Runowo Pomorskie). W październiku 2019 linią kursowały 4 pary pociągów regionalnych relacji Szczecin – Szczecinek i 1 para pociągów regionalnych relacji Runowo Pomorskie – SzczecinekWęgorzyno - rozkład jazdy.
Administracja Miasto jest siedzibą gminy miejsko-wiejskiej. Mieszkańcy Węgorzyna wybierają do swojej rady miejskiej 6 radnych (6 z 15). Pozostałych 9 radnych wybierają mieszkańcy terenów wiejskich gminy Węgorzyno. Organem wykonawczym jest burmistrz. Siedzibą władz jest ratusz przy Rynku.
Burmistrzowie Węgorzyna: Stanisław Jan Konarski (2002–2006) Grażyna Cecylia Karpowicz (2006–2010) Monika Kuźmińska (2010–2024) Krzysztof Gwóźdź (od 2024)
Mieszkańcy Węgorzyna wybierają parlamentarzystów z okręgów z siedzibą komisji wyborczej w Szczecinie, a posłów do Parlamentu Europejskiego z okręgu wyborczego nr 13.