W 1949 roku spadkobiercy Willema Pijpera przekazali w darze Bibliotece Królewskiej (Koninklijke Bibliotheek) wszystkie rękopisy kompozytora. Od tamtego czasu kolekcja ta znacznie wzrosła. Ważnym nabytkiem stał się wyciąg fortepianowy i partie wokalne opery Halewijn, jedynej ukończonej przez kompozytora. Odzwierciedla on bogatą historię wykonań tej opery, opartej na średniowiecznej balladzie „Liedekijn van Heer Halewijn”.
Życie prywatne William Pijper był dwukrotnie żonaty, pierwszy raz z Anette Werker w roku 1918, z którą rozwiódł się w 1926 roku, a po raz drugi z pisarką Emmą van Lokhorst, z którą rozwiódł się w 1936 roku. William Pijper nie miał dzieci.
Znaczenie Jako kompozytor Pijper wypracował własny, indywidualny styl. W przeciwieństwie do wielu współczesnych mu kompozytorów nigdy nie ulegał panującym modom czy systemom. Jako nauczyciel wywarł ogromny wpływ na współczesną muzykę holenderską. Większość znanych holenderskich twórców z lat 50., 60. i 70. studiowała w różnych okresach pod jego kierunkiem.