Znajdują się tu także wyobrażenia aniołów, motywy roślinne i wiecznego ognia.
W transepcie, w blendach, przedstawione zostały cztery malowidła polowych „Ołtarzy Litanii Matki Bożej” autorstwa Mehoffera, z inwokacją „Matko Chrystusowa” napisaną złotymi literami.
W transepcie znajduje się 10 witraży, autorstwa Stanisława Powalisza: Ofiarowanie Chrystusa w świątyni Jerozolimskiej; Zdjęcie z Krzyża; Dogmat Niepokalanego Poczęcia Marii – Immaculata; św. Anna nauczająca Marię; Chrzest Chrystusa w Jordanie; św. Rodzina; Ucieczka do Egiptu; św. Małgorzata Alacoque; św. Franciszek; Wniebowstąpienie.
Nawy boczne Mehoffer zaprojektował także cykl witraży przeznaczonych do naw bocznych. Nie zostały one zrealizowane przed 1939 rokiem. Oryginalne projekty tych witraży odnalazły się wiele lat po wojnie. Wykonano je także w zakładzie Żeleńskich i osadzono w 2002 roku. Na każdym z nich w centrum znajduje się architektoniczny balkonik, na którym artysta umieścił postacie świętych i błogosławionych w asyście niebiańskiej. Święci na witrażach: Teresa, Jolanta, Królowa Jadwiga, Bogumił, Królewicz Kazimierz, Andrzej Bobola, Stanisław Hozjusz i Kinga.