Kaplice boczne Znajdują się po obu stronach prezbiterium. W kaplicy północnej umieszczono gotycki krucyfiks z XV wieku, który pochodzi z rozebranego kościoła św. Jana Chrzciciela (najpierw był tam w belce tęczowej, później w ołtarzu). Został on odrestaurowany według wskazówek Mehoffera. Mehoffer jest także projektantem drewnianych stall przeznaczonych pierwotnie do prezbiterium. Ornamentyka mebli nawiązuje do motywów z drzwi wejściowych staromiejskich kamieniczek w Turku. Do wybuchu II wojny światowej wykonano dwie stalle, które znajdują się w kaplicach bocznych. Według projektu Mehoffera przed 1939 rokiem zamontowano w kaplicach cztery witrażeinformacja widniejąca na tablicy informacyjnej przed kościołem.. Są one podobne, porównywane są do świetlistych kobierców. Różnią się motywami w medalionach, ich tematyka jest związana z symbolami Marii i Jej cnót. Na tło składa się motyw płonących kaganków, sznury różańców, uskrzydlone anioły i dekoracyjny monogram imienia Maria. W kaplicy północnej znajdują się Wieża Dawidowa i Stolica Mądrościinformacja widniejąca na tablicy informacyjnej przed kościołem. (lub według innego źródła Wieża Dawidowa i Tron Salomona), w południowej – Arka Przymierza i Brama Niebieskainformacja widniejąca na tablicy informacyjnej przed kościołem..