W czerwcu 2012 pokonali Narodowy Ruch Wyzwolenia Azawadu, przejmując kontrolę wraz z innymi islamskimi organizacjami kontrolę nad Azawadem, ustanawiając tam prawo szariatu. 1 września 2012 Ruch na rzecz Jedności i Dżihadu w Afryce Zachodniej przejął kontrolę nad miastem Douentza, które leży u południowych bram Azawadu. 19 listopada 2012 MUJAO i Al-Ka’ida Islamskiego Maghrebu przejęły z rąk MNLA miasto Ménaka na południowym wschodzie Azawadu. 20 listopada 2012 ugrupowanie na granicy mauretańsko-senegalskiej w mieście Dima uprowadziło Francuza Gilberto Rodrigueza-Leala. O jego egzekucji poinformowano 22 kwietnia 2014.
MUJAO wzięło udział podczas bitwy o Konnę, zajmując miasto 10 stycznia 2013. Dzień później doszło do interwencji wojsk francuskich w wyniku czego islamiści utracili kontrolę nad miastem. W kolejnych miesiącach ugrupowanie podobnie jak jego sprzymierzeńcy, zostali spacyfikowani podczas francuskiej operacji reagowania militarnego.
Ruch na rzecz Jedności i Dżihadu w Afryce Zachodniej współpracował Zamaskowany Batalion, z którym w sierpniu 2013 ogłoszono fuzję, powołując do życia organizację Al-Murabitun.