W konsekwencji został aresztowany przez Niemców i przebywał w obozie jenieckim..
W niewoli został awansowany do stopnia komandora podporucznika (1 grudnia 1941 roku). Przebywał między innymi w oflagach ., VIII C Juliusburg. i IV C Colditz., wielokrotnie podejmując próby ucieczki. Powiodła się czternasta., z obozu w Stanisławowie ()., 23 listopada 1943 roku. przez podkop wykonany wspólnie z drugim uciekinierem, porucznikiem (późniejszym admirałem) . Uciekinierzy, kierując się na zachód, dostali się do Dystryktu Krakowskiego w Generalnym Gubernatorstwie, gdzie w Jaśle, pod koniec listopada, skontaktowali się z Armią Krajową..
W okupowanej Polsce Dzięki swojemu azjatyckiemu wyglądowi Van der Krap przez pewien czas używał fałszywego dokumentu na tożsamość japońską. Obaj uciekinierzy wyrazili chęć wstąpienia do Armii Krajowej. Dzięki jej pomocy (dokładnie, komórki IKO, która zajmowała się pomocą jeńcom) przedostali się do Warszawy, gdzie dotarli 1 grudnia. Tam na przełomie lat 1943 i 1944 zostali przyjęci do polskiego ruchu oporu, otrzymując żołd... Van der Krap poznał w Warszawie m.in. Zofię Beisertównę, do której plutonu (dowodzonego przez Piotra, inżyniera z Wilna) został początkowo wcielony;