Objaśnienia: Resovia i Unia Tarnów nie otrzymały licencji uprawniającej do gry w II lidze w sezonie 2013/2014, w związku z tym utrzymały się Świt Nowy Dwór Mazowiecki i Concordia Elbląg. Zgodnie z Uchwałą nr VI/96 Zarządu PZPN z 19 kwietnia 2011 drużyny z Rzeszowa i Tarnowa zostały przesunięte na ostatnie miejsce w tabeli. Polonia Warszawa została zdegradowana z Ekstraklasy do ligi okręgowej. W I lidze utrzymał się więc najlepszy ze spadkowiczów – Okocimski KS Brzesko, który terytorialnie powinien spaść do grupy wschodniej, w związku z czym w II lidze utrzymał się kolejny zespół z ligowej tabeli poprzedniego sezonu – Siarka Tarnobrzeg.
Rozgrywki W sezonie 2013/2014 drużyny rozegrały 34 kolejki ligowe po 9 meczów (razem 306 spotkań) w dwóch rundach: jesiennej i wiosennej. Dwa czołowe miejsca w końcowej tabeli premiowane były awansem do I ligi.
Tabela
||rowspan=6|