Zakładano, że w przyszłości spółka będzie realizować przewozy importowanych ze Szwecji rud żelaza.
PPŻnO Słabe wyniki ekonomiczne PŻnO wywołane niekorzystną umową podpisaną ze stroną radziecką i konieczność dopłat do frachtu z budżetu państwa spowodowały, że w 1948 roku spółka została przekształcona w wielozakładowe przedsiębiorstwo państwowe. W 1949 roku, w związku reorganizacją żeglugi śródlądowej, przedsiębiorstwo Państwowa Żegluga na Odrze włączono do Państwowej Żeglugi Śródlądowej. Centralne zarządzanie z Warszawy także jednak przynosiło starty. Decyzją Ministra Żeglugi z 1951 roku przywrócono więc Przedsiębiorstwo Państwowe Żegluga na Odrze. Nowy podmiot miał główną siedzibę dyrekcji we Wrocławiu oraz placówki w: Krośnie, Nowej Soli, Kostrzynie, Szczecinie, a także porty w: Gliwicach, Koźlu, Wrocławiu, Opolu, Malczycach, Cigacicach, warsztaty stoczniowe w Osobowicach, Malczycach oraz bazę remontową w Nowej Soli.