Skład W skład Kongregacji wchodziło początkowo pięciu kardynałów, jednak później ich liczba wzrosła i wahała się od kilkunastu do dwudziestu kilku. Nadto należał do niej z urzędu także Mistrz Świętego Pałacu, wywodzący się zawsze z zakonu dominikanów. Jeden z niższych rangą prałatów (zazwyczaj także dominikanin) pełnił funkcję sekretarza.
Lista prefektów Kongregacji Jérôme Souchier OCist (1571) Guglielmo Sirleto (1571–1585) Marcantonio Colonna (1587–1597) Agostino Valier (1597–1602) Simeone Tagliavia d’Aragonia (1602–1604) Girolamo Bernerio OP (1604–1611) Pompeo Arrigoni, proprefekt (1611) Paolo Emilio Sfondrati (1611–1618) Robert Bellarmin SJ (1618–1621) Bonifacio Bevilacqua (1621–1627) Maffeo Barberini, proprefekt (1622–1623) Giovanni Garzia Millini, proprefekt (1623–1625) Carlo Emmanuele Pio (1627–1641) Luigi Caetani (1641–1642) Bernardino Spada (1642–1661) Marzio Ginetti (1661–1671) Paluzzo Paluzzi Altieri (1671–1698) Girolamo Casanate (1698–1700) Tommaso Maria Ferrari (1700–1716) Carlo Agostino Fabroni (1716–1727) Gianantonio Davia (1727–1740) Leandro di Porzia (1740) Angelo Maria Quirini (1740–1755) Francesco Landi Pietra (1755–1757) Antonio Andrea Galli (1757–1767) Benedetto Veterani (1767–1776) Carlo Rezzonico, proprefekt (1776–1779) Hyacinthe Sigismond Gerdil CRSP (1779–1795) Stefano