Formuła 3 Euro Series 2006 – czwarty sezon Formuły 3 Euro Series. Rozpoczął się 8 kwietnia 2006 roku w Hockenheim, a skończył 29 października tego samego roku na tym samym torze. Tytuł w klasyfikacji kierowców zdobył Brytyjczyk Paul di Resta, a wśród zespołów – francuska ekipa ASM Formule 3.
Lista startowa Zespół Nr Kierowca Klasa Samochód Silnik Rundy ASM Formule 3 1 Sebastian Vettel Dallara F305 Mercedes Wszystkie 2 Paul di Resta Wszystkie 16 Giedo van der Garde Dallara F306 Wszystkie 17 Kamui Kobayashi R Dallara F305 Wszystkie Manor Motorsport 3 Kōhei Hirate Dallara F305 Mercedes Wszystkie 4 Esteban Guerrieri Wszystkie 18 Kazuki Nakajima Wszystkie Prema Powerteam 5 Alejandro Núñez Dallara F306 Mercedes Wszystkie 6 Ronayne O’Mahony Dallara F305 Wszystkie 19 João Urbano R Dallara F306 1-5 Paolo Maria Nocera 6-9 Roberto Streit 10 ASL Mücke Motorsport 7 Sébastien Buemi Dallara F305 Mercedes Wszystkie 8 Jonathan Summerton R Wszystkie Signature-Plus 9 Guillaume Moreau Dallara F305 Mercedes Wszystkie 10 Romain Grosjean Wszystkie 20 Charlie Kimball Dallara F306 Wszystkie 21 Tim Sandtler R Dallara F305 Wszystkie HBR Motorsport 11 Richard Antinucci Dallara F305 Mercedes Wszystkie 41 Cemil Çipa Trophy Dallara F304 Opel 1, 3, 5-7, 9-10 Team ISR 14 Filip Salaquarda Dallara F306 Opel Wszystkie Bas Leinders Junior Racing Team 22