Ustawa o szkolnictwie wyższym z 1990 roku zmieniła statut uczelni, zgodnie z którym jej podstawową jednostką organizacyjną stał się wydział, a na wydziale takimi jednostkami były katedry. Spowodowało to reorganizację Wydziału Inżynieryjno-Ekonomicznego Przemysłu. Instytut Technologii Przemysłu Chemicznego i Spożywczego został zlikwidowany, a zakłady do tej pory wchodzące w jego skład uzyskały od 1 października 1991 roku status samodzielnych katedrKsięga 60-lecia Akademii Ekonomicznej im. Oskara Langego we Wrocławiu, pod red. J. Chumińskiego, Wrocław 2007, s. 499. [on-line] [dostęp 2013-10-16]..
W 1999 roku miała miejsce ostatnia jak do tej pory zmiana nazwy wydziału na Wydział Inżynieryjno-Ekonomiczny. W 2003 roku miała miejsce jeszcze jedna istotna reorganizacja polegająca na powołaniu dwóch instytutów, z których każdy skupiał katedry o podobnym profilu naukowo-badawczymKsięga 60-lecia Akademii Ekonomicznej im. Oskara Langego we Wrocławiu, pod red. J. Chumińskiego, Wrocław 2007, s. 500. [on-line] [dostęp 2013-10-16]..