thumb|250px|Kościół w Fischenthal thumb|250px|Synagoga żydowska w Bazylei Szwajcaria nie ma oficjalnej religii państwowej. Według spisu ludności z 2016 roku dominującą religią wyznawaną przez dwie trzecie ludności jest chrześcijaństwo. Ponad jedną piątą społeczeństwa stanowią niewierzący i nieokreśleni, a największą mniejszością religijną jest islam (5,2%).
W roku 1950, 56,3% mieszkańców Szwajcarii przyznawało się do Kościoła ewangelicko-reformowanego i 41,5% do Kościoła katolickiego. Krajobraz religijny Szwajcarii w ciągu ostatnich lat ulega znaczącym zmianom. Podczas gdy udział regionalnego Kościoła ewangelicko-reformowanego gwałtownie spada na rzecz braku religijności to udział rzymsko-katolików w społeczeństwie pozostaje względnie stabilny ze względu na napływ emigrantów z krajów katolickich.
Szwajcaria odegrała wyjątkową rolę podczas Reformacji, ponieważ stała się domem dla wielu reformatorów. Większe miasta (Berno, Zurych, Bazylea, Genewa) historycznie były i nadal są częściowo protestanckie, a środkowa Szwajcaria i Ticino są tradycyjnie katolickie.