Zarządzeniem nr 012 Komendanta Głównego Straży Granicznej z 7 maja 1991 w sprawie rozwiązania jednostek WOP oraz utworzenia jednostek organizacyjnych Straży Granicznej Minister Spraw Wewnętrznych polecił z dniem 16 maja 1991 rozwiązać Centrum Szkolenia WOP w Kętrzynie istniejące według etatu nr 44/0115 o stanie osobowym na okres „W” 1315 żołnierzy i 61 pracowników cywilnych oraz na okres „P” 985 żołnierzy i 63 pracowników cywilnych. Na jej bazie powstało Centrum Szkolenia Straży Granicznej w Kętrzynie.
Struktura organizacyjna CS WOP thumb|Słuchacze kursu przekwalifikowania kadry strażnic WOP (grudzień 1989) Komenda i pododdziały obsługi Filia Wyższej Szkoły Oficerskiej Wojsk Zmechanizowanych we Wrocławiu – profil WOPII, III, IV rocznik szkolenia od 1983, a od 1986 również I rocznik. Szkoła Chorążych WOP Szkoła Podoficerska WOP Kwatermistrzostwo.
Komendanci centrum płk Witalis Kondratowicz (20.10.1946–30.01.1947) 25px|alt=płk Witalis Kondratowicz ppłk Wilhelm Kazimierz Weber (01.06.1947–23.12.1949) ................. (patrz: komendanci Szkoły Oficerskiej WOP) ppłk Zbigniew Furgała (18.09.1961–04.01.1967) płk Jerzy Okrzeja p.o.