Programy z DOS-a można uruchamiać w systemach Microsoft Windows, OS/2 oraz Linux (za pośrednictwem aplikacji DOSBox lub DOSEMU). Istnieją też darmowe implementacje tego systemu, takie jak FreeDOS. Ponieważ w 32-bitowych systemach z rodziny Windows NT (np. Windows 2000 czy Windows XP) programy z systemu DOS są uruchamiane na tzw. wirtualnej maszynie DOS-a (VDM), która nie pozwala na bezpośredni dostęp programu do sprzętu i ma jeszcze inne ograniczenia, to działają wyłącznie te, które takich odwołań nie wykonują i nie ingerują w system. Do nich należą głównie programy użytkowe, przykładowo edytory tekstu i bazy danych.
Ważniejsze systemy tej klasy: dla komputerów Commodore 64 dla ośmiobitowych komputerów Atari – Atari DOS, SuperDOS, SpartaDOS, MyDOS i inne dla komputerów Amiga – AmigaDOS dla komputerów Robotron – UDOS dla komputerów klasy IBM-PC QDOS, 86-DOS – pierwowzór systemu MS-DOS PC-DOS firmy IBM MS-DOS firmy Microsoft DR-DOS firmy Digital Research Novell DOS firmy Novell FreeDOS – wolne oprogramowanie do bezpłatnego pobrania PTS-DOS rosyjskiej firmy PhysTechSoft ROM-DOS – zaprojektowany do używania w