thumb|Święty Karol Boromeusz (zm. 1584) przez krótki czas był kardynałem inkwizytorem generalnym 2 sierpnia 1564 Pius IV przekształcił trybunał Rzymskiej Inkwizycji w stałą kongregację kardynalską Kurii Rzymskiej. W jej składzie pozostało tylko ośmiu z dwudziestu siedmiu dotychczasowych jej członków: Michele Ghislieri OP (jako wielki inkwizytor), Giovanni Michele Saraceni, Giovanni Battista Cicala, Jean Suau, Clemente d’Olera OFMObs, Ludovico Simonetta, Vitellozzo Vitelli, Karol Boromeusz.
W 1565 skład kongregacji uzupełniono jeszcze o kardynała Francesco Alciatiego, zatem w chwili śmierci Piusa IV Kongregacja liczyła 9 kardynałów inkwizytorów. Jeden z nich, kardynał Michele Ghislieri został następcą Piusa IV jako papież Pius V.
Mianowani przez Piusa V (7 stycznia 1566 – 1 maja 1572) Pius V na początku swego pontyfikatu odwołał wszystkich inkwizytorów generalnych mianowanych przez poprzednika i wyznaczył na ich miejsca swoich nominatów. Scipione RebibaPowtórna nominacja. (7 lutego 1566 – 23 lipca 1577, wielki inkwizytor od 8 kwietnia 1573)Pastor, XVII, s.