Eugeniu Cebotaru (ur. 16 października 1984 w Kiszyniowie) – mołdawski piłkarz grający na pozycji środkowego pomocnika. Od 2012 jest zawodnikiem klubu Spartak Nalczyk.
Kariera klubowa Swoją karierę piłkarską Cebotaru rozpoczął w klubie Zimbru Kiszyniów. W sezonie 2003/2004 zadebiutował w jego barwach w pierwszej lidze mołdawskiej. W sezonach 2005/2006 i 2006/2007 wywalczył z Zimbru wicemistrzostwo Mołdawii. W sezonie 2006/2007 zdobył też Puchar Mołdawii.
Na początku 2007 roku Cebotaru przeszedł do klubu Ceahlăul Piatra Neamț. Swój debiut w nim zanotował 24 lutego 2007 w zremisowanym 1:1 wyjazdowym meczu z CFR Cluj. W sezonach 2008/2009 i 2010/2011 grał z nim w drugiej lidze rumuńskiej.
Na początku 2012 roku Cebotaru odszedł z Ceahlăul Piatra Neamț do Spartaka Nalczyk. Zadebiutował w nim 7 maja 2012 w zremisowanym 1:1 wyjazdowym meczu z Tomem Tomsk. W sezonie 2011/2012 spadł ze Spartakiem z Priemjer-Ligi do Pierwszej Dywizji.