Zarządzeniem nr 012 Komendanta Głównego Straży Granicznej z 7 maja 1991 w sprawie rozwiązania jednostek WOP oraz utworzenia jednostek organizacyjnych Straży Granicznej Minister Spraw Wewnętrznych polecił z dniem 16 maja 1991 rozwiązać Batalion Graniczny Karpackiej Brygady WOP w Nowym Targu istniejący według etatu nr 44/088 o stanie osobowym na okres „W” 511 żołnierzy i 8 pracowników cywilnych oraz na okres „P” 399 żołnierzy i 8 pracowników cywilnych.
Struktura organizacyjna W 1954 batalionowi podlegały: 187 strażnica WOP Szlachtowa 188 strażnica WOP Sromowce Niżne 189 strażnica WOP Kacwin 190 strażnica WOP Jurgów 191 strażnica WOP Łysa Polana 192 strażnica WOP Zakopane Kuźnica PKPT Kasprowy Wierch.
W 1956 batalionowi podlegały: 1 strażnica WOP Szlachtowa 2 strażnica WOP Sromowce Niżne 3 strażnica WOP Kacwin PKRT Niedzica 4 strażnica WOP Jurgów PKMRG Jurgów 5 strażnica WOP Łysa Polana PKRT Morskie Oko 5 strażnica WOP Zakopane Kuźnica PKRT Kasprowy Wierch 7 Strażnica WOP Kiry.