Dowodził siłami syryjskimi tłumiącymi powstanie w Darze, gdzie według raportu Human Rights Watch jego żołnierze dopuścili się zbrodni na ludności cywilnejCrimes against Humanity and Other Violations in Daraa. Po tych wydarzeniach zyskał przydomek "rzeźnika z Dary", był także określany jako człowiek budzący w Syrii największy strach.
29 kwietnia 2011 Mahir al-Asad, z powodu swojego udziału w tłumieniu wystąpień antyrządowych, został objęty sankcjami Unii Europejskiej i USA. Prawdopodobnie osobiście dowodził wiernymi rządowi wojskami przy odbijaniu z rąk opozycji Dżisr al-Szughur w czerwcu tego samego roku. Wspierający opozycję rząd Turcji oskarżył podległe mu siły o szczególne okrucieństwo.
Po zamachu bombowym 18 lipca 2012 w Damaszku, w którym zginęli syryjski minister obrony Dawud Radżiha, gen. Hasan Turkumani, wiceminister obrony Asif Szaukat oraz kierujący Biurem Bezpieczeństwa Narodowego Regionalnego Kierownictwa Partii Baas Haszim Ichtijar, pojawiły się doniesienia, jakoby Mahir al-Asad został ciężko ranny. Informowano, jakoby stracił obieReport: Assad's brother 'fighting for his life,' month after Damascus bomb attack lub tylko jedną nogęSyria: Bashar al-Assad's brother Maher 'loses leg'U.N.