Kościoły ewangelickie Kościół Ewangelicko-Augsburski: Diecezja katowicka (część) – parafie: Kraków (filiał – Wieliczka); Nowy Sącz Kościół Ewangelicko-Prezbiteriański w Polsce – Parafia Ewangelicko-Prezbiteriańska Chrystusa Zbawiciela w Krakowie. Kościół Ewangelicko-Reformowany – diaspora w Krakowie
Metodyzm Kościół Ewangelicko-Metodystyczny – parafie: Kraków, Tarnów. Ewangeliczny Kościół Metodystyczny w RP – parafia: Kraków
Pentekostalizm Chrześcijańska Wspólnota Zielonoświątkowa – zbory: Trzebinia, Świebodzin, Wysowa-Zdrój Ewangeliczna Wspólnota Zielonoświątkowa – zbór: Gorlice Kościół Boży w Chrystusie – kościoły: Kraków (Kościół „Chrystus Królem” w Krakowie, Kościół „Wspólnota Odkupionych Chrześcijan”, Iris Global Kraków), Lubasz (placówka), Zakopane Kościół Boży w Polsce – kościoły: Kraków (Chrześcijańska Wspólnota Bezdomnych „Dom Łazarza”, Kościół Boży „Dom Miłosierdzia”, Kościół „Słowo Życia” Foursquare, Kościół Boży „Syloe”, Kościół Chrześcijański „Nowa Nadzieja”, Kościół Jezusa Chrystusa w Krakowie, Kościół Boży „Łaska Chrystusa”, Kościół „Kierunek Jezus”, Międzynarodowy Kościół Nazarejczyka);