Uniwersytet Otago był pierwszą w Imperium Brytyjskim uczelnią, gdzie kobiety miały prawo do studiowania. Był również pionierem walki o prawa kobiet. Prawdopodobnie publikacja Mary Ann Müller pt. Odwołanie do mężczyzn z Nowej Zelandii (1869) pomogła w osiągnięciu celu zapewnienia kobietom równego dostępu do edukacji.
Wydziały Nauczanie jak i badania naukowe odbywają się w ramach następujących wydziałów: Szkoła Biznesu: Wydział Rachunkowości i Finansów Wydział Ekonomii Wydział Przedsiębiorczości Wydział Programów Wykonawczych Otago MBA Wydział Edukacji dla Kadry Zarządzającej Wydział Informacji Naukowej Wydział Informatyki Medycznej Wydział Biznesu Międzynarodowego Wydział Zarządzania Wydział Marketingu Wydział Turystyki wydziały nauk o zdrowiu: Centrum Bioetyki Naukowe Laboratorium Medyczne Wydział Stomatologii Wydział Farmaceutyczny Szkoła Fizjoterapii Szkoła Nauk Medycznych Wydział lekarski Szkoła Medyczna w Dunedin Uniwersytet Otago w Christchurch Uniwersytet Otago w Wellington wydziały nauk humanistycznych: Wydział Antropologii i Archeologii Wydział Kilologii Klasycznych (łacina i greka) Kolegium Edukacji – Te Kura Akau Taitoka Wydział Filologii Angielskiej i Językoznawstwa Wydział Geografii Wydział Historii i Historia Sztuki Wydział Języków i Kultury Wydział Prawa Wydział Mediów, Filmu i