W ostrołukowej tęczy znajduje się profilowana belka tęczowa z barokowym krucyfiksem z XVIII wieku. Szczególną uwagę zwraca siedem gotyckich portali w tzw. typie długoszowskim. We wnętrzu kościoła szczególnie warto zwrócić uwagę na tabernakulum ścienne, które znajduje się we wschodniej części muru prezbiterium. W ołtarzu głównym kościoła znajduje się pochodząca z 1863 roku kopia późnogotyckiego tryptyku ufundowanego przez Jakuba z Dębna i jego żonę Barbarę z JarosławskichP. Bielak, A. Własnowolska-Bielak, Gmina i Okolice Dębno - przewodnik turystyczny. Wyd. Progress, Urząd Gminy Dębno 2013, s.30.
Oryginalny późnogotycki tryptyk ufundowany przez Jakuba z Dębna znajduje się w Muzeum Narodowym w Krakowie. Natomiast w Muzeum Diecezjalnym w Tarnowie znajdują się dwie pochodzące z kościoła św. Magdaleny gotycko-renesansowe rzeźby: Matki Boskiej i św. Jana Chrzciciela.
Kaplica grobowa Jastrzębskich
thumb|150px|right|Kaplica grobowa Jastrzębskich w Dębnie