Strażnica Jastarnia otrzymała numer 2.
Wiosną 1958 strażnice podporządkowane 163 batalionowi podporządkowano bezpośrednio pod sztab 16 Brygady WOP (Jastarnia, Władysławowo, Babie Doły, Sopot, Sianki, oraz dotychczasowe strażnice 161 batalionu WOP: Sobieszewo, Jantar, Sztutowo, Krynica Morska)Rozkaz dowódcy WOP nr 05/org.mob. z 21.04.1958 ()..
1 stycznia 1960, pozostając nadal w systemie brygadowym, odwrócono numerację. Strażnica WOP Jastarnia otrzymała numer 6.
1 stycznia 1964, strażnica WOP nr 3 Jastarnia uzyskała status strażnicy lądowej i zaliczona została do III kategorii.
1 lipca 1971 Strażnica WOP Jastarnia była w strukturach Kaszubskiej Brygady WOP
Zarządzeniem dowódcy WOP z 17 lutego 1976 16 Kaszubska Brygada WOP 1 czerwca 1976 przeszła na dwuszczeblowy system dowodzenia podporządkowując strażnice bezpośrednio pod sztab brygady. Z kolei na podstawie zarządzenia dowódcy WOP z 25 lipca 1976 brygada otrzymała nazwę Kaszubska Brygada Wojsk Ochrony Pogranicza.
Ochrona granicy Do 1948, czyli do czasu powołania placówek kontroli ruchu rybackiego (PKRR), strażnica zajmowała się także kontrolą kutrów rybackich.