Hirota odmówił i podał się z całym rządem do dymisji, powołując się na brak jedności w nim.. lewo|mały|Hisaichi Terauchi (po prawej), przemawiający z trybuny w japońskim parlamencie w trakcie swojego sporu z Hamadą Kunimatsu, który doprowadził do dymisji rządu Hiroty (na zdjęciu za Terauchim) Po dymisji został w maju 1937 roku członkiem Izby Arystokracji. W czerwcu tego samego roku ponownie został ministrem spraw zagranicznych w rządzie Fumimaro Konoe. Jako minister prowadził z polskim rządem rozmowy, które doprowadziły do podniesienia poselstw Polski i Japonii do rangi ambasad. Na stanowisku pozostał przez niespełna rok do maja 1938 roku, kiedy przeszedł na emeryturę. Jego ponowne objęcie tej funkcji zbiegło się z wybuchem drugiej wojny chińsko-japońskiej oraz masakrą nankińską, o której przebiegu zdawał sobie sprawę jako członek ówczesnego rządu.
Po przejściu na emeryturę, w czasach II wojny światowej pojawiał się często na dworze cesarskim jako doradca cesarza Hirohito. W maju 1945 roku powrócił z emerytury, aby z polecenia władz japońskich prowadzić negocjacje z ZSRR. W tym czasie oba kraje nadal były objęte paktem o nieagresji, pomimo faktu, że wszystkie inne mocarstwa sprzymierzone wypowiedziały wojnę Japonii.