Tom IV Wydany w 1998 roku, obejmuje lata 1987-1989. Opracowanie: Zofia Wilińska i Danuta Gułajewska. Omówiono 6055 publikacji.Z. Wilińska, D. Gułajewska, Jan Paweł II. Bibliografia polska 1987-1989, Rzym 1998, s. 590. Bibliografia nie uwzględnia, ze względu na kryteria formalno-wydawnicze, tzw. wydawnictw podziemnych PRL-u.Z. Wilińska, D. Gułajewska, Jan Paweł II. Bibliografia polska 1987-1989, Rzym 1998, s. 6. Osobną monografię w opracowaniu Anny Sitarskiej i Stefanii Skwirowskiej pt. Jan Paweł II poza cenzurą PRL bibliografia 1976-1989 Ośrodek wydał w 1996 roku. Omówiono 3220 publikacji kolportowanych poza oficjalnym obiegiem.A. Sitarska, S. Skwirowska, Jan Paweł II poza cenzurą PRL bibliografia 1976-1989, Rzym 1996, s. 450.
Tom V Wydany w 2001 roku, obejmuje lata 1990-1991. Opracowanie: Zofia Wilińska i Danuta Gułajewska. Omówiono 4517 publikacji.Z. Wilińska, D. Gułajewska, Jan Paweł II. Bibliografia polska 1990-1991, Rzym 2001, s. 516. Autorki opracowania zauważyły, że w wyniku przeobrażeń ustrojowych, wiele efemerycznych oficyn nie przekazywało Bibliotece Narodowej obowiązkowego egzemplarza, a tym samym, w tej najważniejszej wszechnicy narodowej zbiory archiwalne są wybrakowane, co przy niewystarczających źródłach informacyjnych stanowiło dla badaczy ogromne utrudnienie przy gromadzeniu materiałów.Z. Wilińska, D.