Przebudowa obejmująca naprawę układu torowego i hali przeznaczonej na magazyn, modernizację sieci trakcyjnej i hali pociągowej oraz budowę myjni całorocznej, budynku biurowego, dróg, chodników i parkingów miała kosztować około 40 mln zł brutto i zostać wykonana w ciągu 5 lat od podpisania umowy z wykonawcą.
31 grudnia 2014 SKM Warszawa podpisała z Trakcją PRKiI umowę na wykonanie dokumentacji projektowej i robót budowlano-montażowych na terenie zaplecza techniczno-postojowego Warszawa Szczęśliwice. Czas wykonania modernizacji to 24 miesiące, a jej koszt to 45 mln zł netto (56,5 mln zł brutto). Na początku maja 2015 przewoźnik planował zaciągnąć kredyt na realizację zadania w wysokości 40 mln zł. Pozostałe 16,5 mln zł miałoby pochodzić ze środków własnych.
W połowie grudnia 2016 inwestycja dobiegała końca. Wśród wykonanych prac znajdowała się m.in. modernizacja większości hali całopociągowej, do której dobudowano myjnię, a także elektryfikacja wszystkich torów na terenie stacji. Planowano wówczas, że wszystkie prace zostaną ukończone do końca roku, zaś w I kwartale następnego, po odbiorach technicznych i otrzymaniu pozwoleń, obiekt będzie całkowicie dostępny. Ostatecznie do końca 2016 wykonano wszystkie prace budowlano-montażowe oraz miały miejsce odbiory częściowe według branż.