Will trafia na „Latającego Holendra”, gdzie spotyka swojego ojca i zdobywa klucz do skrzyni. Równocześnie Jack, Elizabeth i Norrington docierają na wyspę, gdzie ukryty jest skarb. Na miejscu dochodzi do walki m. in. o skrzynie. Ostatecznie serce przejmuje Norrington i przekazuje je Kompanii, dając jej kontrolę nad Jonesem. W finale Kraken atakuje „Czarną Perłę”, a Jack zostaje wciągnięty w morską otchłań. Elizabeth, Will i reszta załogi postanawiają go odzyskać. Ich nowym kapitanem zostaje Barbossa.
Piraci z Karaibów: Na krańcu świata Cutler Beckett przejmuje kontrolę nad morzami dzięki władzy nad Davy’m Jonesem i zaczyna eliminować piratów. Will, Elizabeth i Barbossa wyruszają do Singapuru po mapę, która prowadzi do świata umarłych, gdzie znajduje się Jack Sparrow. Udaje im się go odnaleźć i sprowadzić z powrotem.
Po powrocie piraci próbują się zjednoczyć przeciwko Kompanii - podczas Trybunału Braci Elizabeth zostaje wybrana Królem Piratów i decyduje o walce. Barbossa uwalnia boginię mórz Calypso, lecz ta zamiast pomóc, wywołuje ogromny wir morski. W finałowej bitwie „Czarna Perła” walczy z „Latającym Holendrem”. Will i Elizabeth biorą ślub, ale Will zostaje śmiertelnie ranny przez Jonesa.