1 stycznia 1960 do gromady Miłakowo włączono wsie Bieniasze i Nowe Mieczysławy oraz osady Niegławki, Kłodziń, Stare Mieczysławy i Wojciechy ze zniesionej gromady Włodowo w tymże powiecieUchwała Nr III/9f/59 Wojewódzkiej Rady Narodowej w Olsztynie z dnia 21 lipca 1959 r. w sprawie zniesienia niektórych gromad w województwie olsztyńskim (Dziennik Urzędowy Wojewódzkiej Rady Narodowej w Olsztynie z dnia 30 grudnia 1959 r., Nr. 28, Poz. 81).
1 stycznia 1969 z gromady Miłakowo wyłączono: obszar o powierzchni 4 ha leżący między PGR Stolno a szosą Morąg-Orneta, włączając go do gromady Orneta w powiecie braniewskim; obszar o powierzchni 3 ha leżący między PGR Stolno a szosą Morąg-Orneta a stykiem granic powiatów morąskiego i braniewskiego, włączając go do gromady Bażyny w powiecie braniewskim; obszar o powierzchni 11 ha leżący między stykiem granic powiatów morąskiego, braniewskiego i lidzbarskiego a wsią Kłodzin, włączając: 4 ha go do gromady Lubomino w powiecie lidzbarskim; 7 ha go do gromady Rogiedle w powiecie lidzbarskim – w tymże województwie.