W tym samym spotkaniu nabawił się kontuzji więzadła krzyżowego przedniego, która wykluczyła go z gry na 8-9 miesięcy.
Kariera reprezentacyjna 7 września 2015 zadebiutował w reprezentacji Polski w wygranym 8:1 meczu z Gibraltarem, pojawiając się na boisku jako rezerwowy w 62. minucie, po czym w 73. minucie zdobył swojego debiutanckiego gola. 13 listopada 2015 wystąpił w towarzyskim meczu przeciwko Islandii. Wszedł na boisko w 65. minucie, a chwilę później strzelił swoją drugą bramkę w reprezentacji.
Kilka miesięcy później został powołany na mistrzostwa Europy 2016 we Francji. Zadebiutował w nich 12 czerwca 2016 w wygranym 1:0 meczu z Irlandią Północną, zostając uznanym za jednego z najlepszych na boisku. 15 czerwca GOAL.com wybrało go do jedenastki pierwszej kolejki fazy grupowej Euro 2016https://transfery.info/aktualnosci/goal-najlepsza-11-pierwszej-kolejki-euro-2016-jest-polak/89458.
4 września 2016 strzelił gola w 9. minucie zremisowanego 2:2 meczu eliminacji mistrzostw świata 2018 z Kazachstanem.
15 października 2024 r., po 8 latach przerwy Kapustka wrócił do reprezentacji, w zremisowanym 3:3 meczu z reprezentacją Chorwacji.