Okres największej aktywności religijnej przypadł na wiek XIX i XX, kiedy to powstały zachowane do dziś cerkwie: cerkiew greckokatolicka pod wezwaniem Narodzenia Najświętszej Maryi Panny (powstała w 1814 roku, prawdopodobnie z zachowaniem wieży z budowli poprzedniej, być może z XVII wieku), cerkiew prawosławna pod wezwaniem Narodzenia Najświętszej Maryi Panny z 1932 roku (Królowa Górna – zniszczona w 1960 roku), cerkiew greckokatolicka pod wezwaniem św. Dymitra w zbudowana w 1858 roku, oraz cerkiew prawosławna pod wezwaniem Najświętszego Zbawiciela z około 1938 roku (Bogusza).
W związku z wysiedleniem Łemków i przybyciem do Królowej ludności wyznania rzymskokatolickiego zachodziła potrzeba założenia parafii tego wyznania. Już 4 września 1946 roku biskup tarnowski Jan Stepa erygował w Królowej Górnej placówkę duszpasterską rzymskokatolicką. W jej skład weszły Królowa Ruska, Bogusza (obecnie samoistna parafia) oraz Królowa Polska, należąca dotychczas do parafii w Mystkowie. Rektorem placówki w Boguszy zamianował księdza kanonika Władysława Berbekę, który został wkrótce mianowany pierwszym proboszczem. Zmieniło się także wezwanie greckokatolickiej cerkwi w Boguszy (powstał kościół pod wezwaniem św. Antoniego Padewskiego).