Iluminacje Większą popularność Jakob Elsner zdobywał jako iluminator książek. Fryderyk III, będąc pod wrażeniem jego prac, stawiał je na równi z pracami Nikolausa Glockendona. W 1504 roku Elsner rozpoczął prace nad zilustrowaniem dwutomowej Gänsebuch (Biblioteka Morgana, Nowy Jork)Jakob Elsner i Geese Book on-line zleconą przez proboszcza kościoła św. Wawrzyńca, Antona Kressa. Pierwszy tom został ukończony w 1507 roku, drugi w 1510. Elsner dekorował kilka manuskryptów dla Fryderyka, elektora.
Przypisywane prace Obrazy Tryptyk Conrata Imhofa – 1486, 22 x 36 cm, Bavarian Nation, Monachium Portret Bertruda Reussa – data 1394 w górnym prawym rogu została dodana później; 29 x 20 cmArtnet Portret mężczyzny – 28,9 x 24 cm., dawna kolekcja Louisa Jay, Frankfurt nad MenemArtnet Portret Oblubieńca – 1498 Germanisches Nationalmuseum, Norymberga Portret 28 letniego Jörga Ketzlera – 1499 Germanisches Nationalmuseum, Norymberga Portret radnego Heinricha Schilthera – 1486, Akademia Sztuk Pięknych w Wiedniu, Wiedeń Portret Thomasa Reussa – ok.