Jednakże od odejścia w 2006 z Uniwersytetu Jagiellońskiego, gdzie Łukaszyk uskarżała się na mobbing i wrogość ze strony przełożonych i kolegów, nie była już dopuszczana do pracy dydaktycznej w zakresie filologii portugalskiej, mimo iż nadal realizowała w tej dziedzinie badania finansowane ze środków publicznychM.in. w latach 2013-2015 grant OPUS Narodowego Centrum Nauki pt. "Styl późny" w twórczości José Saramago, 2012/05/B/HS2/03986. https://projekty.ncn.gov.pl/index.php?projekt_id=185326.
Publikacje Ewa Łukaszyk jest autorką ponad 200 publikacjiORCID: https://orcid.org/0000-0001-9969-0459Ewa Łukaszyk, List of Publications https://www.ewalukaszyk.com/uploads/2/0/4/9/20493194/ewa_lukaszyk_publications.pdf, w tym monografii, artykułów i recenzji w cenionych polskich i zagranicznych czasopismach naukowychSCOPUS: https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=56436640800. Była także tłumaczką oraz redaktorką i współredaktorką tomów zbiorowych. Zamieszcza również eksperymentalne eseje typu work-in-progress na stronie internetowej pt. Nomadian, eksplorując relacje pomiędzy dyskursami humanistyki a obrazem, a także pomiędzy globalnym literaturoznawstem a podróżą i szerzej, doświadczeniem osobistym czytającego podmiotu. Współczesna proza portugalska (1939–1999), Kraków: Universitas, 2000. Terytorium a świat.