Pierwsze mecze rozegrano w dniach 14–15 lipca, natomiast rewanże tydzień później.
drużyny, które awansowały z I rundy kwalifikacyjnej
Grupa 1 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. APOEL Nikozja 35,460 NK Maribor 22,225 Maccabi Tel Awiw 18,200 Lech Poznań 17,300 Qarabağ FK 11,500 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. FK Sarajevo 5,500 FK Astana 3,825 Rudar Pljevlja 3,375 Wardar Skopje 3,175 Hibernians 1,591
Grupa 2 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. Celtic 39,080 BATE Borysów 35,150 Malmö FF 12,545 HJK Helsinki 11,140 Molde FK 10,375 FC Midtjylland 7.960 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. Lincoln Red Imps 2,666 FK Ventspils 5,350 Žalgiris Wilno 3,900 Piunik Erywań 3,550 Stjarnan 3,100 Dundalk F.C. 2,150
Grupa 3 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. Steaua Bukareszt 40,259 Łudogorec Razgrad 25,350 Dinamo Zagrzeb 24,700 Partizan Belgrad 14,775 Videoton FC 7,950 Skënderbeu Korcza 5.575 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. Dila Gori 4,875 AS Trenczyn 4,250 Crusaders F.C. 4,200 Milsami Orgiejów 3,750 The New Saints F.C.