24 lutego 1941 otworzył na Placu Wolności 8 w Poznaniu przedsiębiorstwo Foto-Stewner. W 1944 otrzymał powołanie do Wehrmachtu, gdzie był kancelistą i specjalistą-fotografem. 19 stycznia 1945 rodzina opuściła Poznań i udała się do Turyngii – sam Ernst, z uwagi na chorobę pozostał w mieście i opuścił je dopiero 22 stycznia 1945 ostatnim pociągiem sanitarnym przez Frankfurt nad Odrą. W lipcu 1945 został udziałowcem i dyrektorem handlowym przedsiębiorstwa chemicznego Heinrich Ratjen (następnie Peschken-Stewner GmbH) w Nienburgu nad Wezerą. Cała rodzina osiedliła się tam ostatecznie w 1946. Od 1955 kilkakrotnie odwiedzał Poznań, gdzie spotykał się z dawnymi współpracownikami. W 1985 założył fundację. W 1969 sprzedał przedsiębiorstwo. Zmarł 26 listopada 1996Opisy do wystawy Ernst Stewner – niemiecki fotograf Polski, CK Zamek, Poznań, 2014..