Zmarł nagle 6 czerwca 1939 w Warszawie wskutek powikłań po zapaleniu wyrostka robaczkowego. Został pochowany 9 czerwca 1939 w kwaterze legionowej Cmentarza Wojskowego na PowązkachZgon płka A. Gluth-Nowowiejskiego, „Polska Zbrojna” Nr 156 z 7 czerwca 1939 roku, s. 2, 4. Pogrzeb ś.p. płka Gluth-Nowowiejskiego, „Polska Zbrojna” Nr 159 z 10 czerwca 1939 roku, s. 2. (kwatera A21-tuje-1/2)Wyszukiwarka cmentarna - Warszawskie cmentarze.
Rodzina W 1919 ożenił się z Marią Bronisławą z Kaszów (1896–1986), członkinią POW ps. „Mirska” w Miechowie, odznaczoną Krzyżem Walecznych i Medalem Niepodległości, z którą miał czterech synów, w tym bliźniaków Zbigniewa i Jerzego, uczniów Gimnazjum Stefana Batorego i żołnierzy Armii Krajowej: Zbigniewa Mieczysława ps. „Nowacki”, „Nowak” (1920–1944), rozstrzelany na Pawiaku; Jerzego Tadeusza ps. „Pigi” (1920–1944), kapral podchorąży w 2. kompanii Batalionu Golski, poległ na Powiślu; Janusza ps. „Ścieżyński” (1922–1944), rozstrzelany na Pawiaku; Wacława ps.