Trapelus sanquinolentus, Phrynocephalus helioscopus, kilka przedstawicieli Eremias) i jeden gatunek żółwia. W Czerwonej Księdze Kazachstanu figuruje przedstawiciel agamowatych – Phrynocephalus versicolor.
Ostoja ptaków W parku występuje 155 gatunków ptaków; to 19,8% wszystkich gatunków lęgowych Kazachstanu. Ze względu na występowanie 16 gatunków BirdLife International uznało Park Narodowy „Ałtynemel” za ostoję ptaków IBA. Wśród nich jest jeden nielęgowy – pelikan kędzierzawy (Pelecanus crispus) – oraz trzy osiadłe, dzięcioł białoskrzydły (Dendrocopos leucopterus), bogatka siwa (podgatunek bogatki, Parus major bokharensis) i wróbel mongolski (Passer ammodendri). Do pozostałych gatunków, jedynie gniazdujących w parku, należy jeden zagrożony, raróg zwyczajny (Falco cherrug) i jeden narażony – gołąb brunatny (Columba eversmanni). Sęp kasztanowaty (Aegypius monachus) jest bliski zagrożenia. Pozostałe ptaki, gatunki najmniejszej troski, to: pustułeczka (Falco naumanni), sieweczka pustynna (Charadrius leschenaultii), pustynnik zwyczajny