Odrodzenie mały|Jews' Sally Port, Valletta W 1530 król hiszpański Karol V przekazał Maltę joannitom. Rycerze władali wyspą do 1798; wielu sycylijskich conversos (przechrzczonych Żydów) przeniosło się tutaj, pamiętając liberalną politykę joannitów wobec Żydów na Rodos, lecz musieli oni nadal praktykować swoją religię w tajemnicy. Po Wielkim Oblężeniu, w okresie rządów joannitów, nie było wolnej ludności żydowskiej na Malcie. Po osiedleniu się na Malcie joannici, posiadając flotę galer, często brali pasażerów, wśród których byli również Żydzi, statków handlowych jako zakładników, a następnie żądali okupu w zamian za uwolnienie. W tym czasie było bardzo wielu żydowskich niewolników na Malcie, i wyspa była często z tego powodu wymieniana w żydowskiej literaturze z tego okresuHecht, Esther: The Jewish Traveler: Malta in Hadassah Magazine.. Wolni Żydzi, którzy chcieli odwiedzić Maltę, po uzyskaniu zgody Wielkiego Mistrza, mogli wejść do Valletty jedynie przez małą bramę, zwaną do dziś Jews' Sallyport.