W jednym z wniosków paszportowych deklarował przynależność do PZPR, choć, jak sam później twierdził, do partii nigdy nie należał.
Działalność biznesowa Prowadził w Warszawie własną firmę montującą telewizję kablową, przejętą przez Porion, a następnie Aster City Cable. Podjął studia na kierunku pedagogika na Uniwersytecie Warszawskim, których nie ukończył. Po 1996 zasiadał w radzie nadzorczej i zarządzie browaru w Krotoszynie, który upadł z powodu zadłużenia. W 2002 Marek Jakubiak wykupił od koncernu Brau Union browar w Ciechanowie. Na bazie ciechanowskiego zakładu piwowarskiego zbudował w ciągu kilku lat przedsiębiorstwo branży browarniczej, a później holding BRJ. Zorganizował m.in. własną sieć dystrybucji, rozwijał produkcję piwa niepasteryzowanego (Ciechan Wyborne). W kolejnych latach poprzez swoje przedsiębiorstwo (spółkę Browar Ciechan, przekształconą w Browary Regionalne Jakubiak) nabywał i rozwijał produkcję w innych browarach regionalnych w tym browarze w Bojanowie i browarze Lwówek. Grupa ta w 2014 produkowała ponad 30 marek piwa.
W mediach pojawiły się opinie, że to dzięki Markowi Jakubiakowi w Polsce zaczęła się moda na piwa regionalne. Został laureatem Medalu Złoty Chmiel (2009) oraz Nagrody im.