Stoczyła zwycięskie bitwy: 14 czerwca 1920 koło latarnik morskiej Nieżniebierdjanskiej, 9 lipca koło mierzei Krywyj Kos i 10–14 lipca ostrzeliwał desant wojsk białogwardyjskich Nazarowa, 24–27 sierpnia brał udział w walkach przeciwko desantowi gen. Ułagaja i postawił pola minowe w zalewie Achtarskiem. W nocy 24 sierpnia 1920 roku wysadził desant wojsk radzieckich, które zajęły Primorsko-Achtarskaja. 13 września walczyła na radzie Geniczeska i 15 września odbyła zwycięską bitwę koło półwyspu Obyticzna kosa.
W czerwcu 1921 roku został rozwiązany, a jej skład i okręty włączono w skład Floty Czarnomorskiej. Dowódcy Stiepan Markiełow (marzec - kwiecień 1920) Jewgienij Gierniet (kwiecień - sierpień 1920) Siergiej Chwieckij (wrzesień - listopad 1920) Boris Dandre (grudzień 1920 - kwiecień 1921) Iwan Kadackij-Rudniew (kwiecień - czerwiec 1921)
II wojna światowa
Pierwsze formowanie Po raz pierwszy flotylla została sformowana w składzie Floty Czarnomorskiej w sierpniu 1941 na podstawie rozkazu Ludowego Komisarza Mar. Woj. z 22 lipca 1941 celem udzielenia pomocy wojskom Frontu Południowego w działaniach obronnych na kierunkach nadmorskich i zabezpieczenia transportów na Morzu Azowskim.