W 2007 roku system studiów został przekształcony na kompatybilny do systemu bolońskiego. Obecnie na czterech wydziałach uczelnia oferuje 10 programów licencjackich i 14 magisterskich.
W roku 2015 w uczelni w Hamburgu studiowało ok. 2320 studentów, w tym ok. 320 kobiet, ok. 60 cudzoziemców i 50 cywilów. Zajęcia prowadzi ok. 90 profesorów i ponad 900 innych pracowników. W sumie uniwersytet oferuje 2500 miejsc dla studiujących.
Ze względu na studium w trymestrach można studiować na uczelniach Bundeswehry bardzo intensywnie, szybciej niż na uczelniach cywilnych. Dlatego licencjat można tu zdobyć w przeciągu trzech, a tytuł magistra w przeciągu czterech lat. Ponadto HSU kładzie nacisk na interdyscyplinarność studiów oraz powiązanie z praktyką. Większość studentów podczas studiów mieszka na terenie miasteczka uniwersyteckiego i chwali sobie zarówno krótkie drogi, jak i studia w małych grupach. Do dyspozycji studentów i nauczycieli akademickich jest otwarta w trybie ciągłym biblioteka. W jej zbiorach znajduje się 710 000 tomów oraz ok. 1600 drukowanych i ponad 3000 cyfrowych czasopism. Jej roczny budżet na zakup nowych mediów wynosi 1,6 mln euro, z czego ⅓ jest zarezerwowana na media cyfrowe, przez co jej zbiory wyróżniają się swą aktualnością.