4 stycznia 2017 w serwisie Onet.pl ukazał się artykuł Janusza Schwertnera i Andrzeja Gajcego Jak Mateusz Kijowski wystawiał faktury KOD-owi, w którym ujawnili, że ponad 90 tysięcy złotych, będące częścią pieniędzy ze zbiórek publicznych na Komitet Obrony Demokracji, trafiło na konto firmy Kijowskiego i jego żony w wyniku wystawionych przez nich faktur za świadczenie usług informatycznych.
17 stycznia 2017 Zarząd Stowarzyszenia KOD podjął uchwałę, w której wezwał Mateusza Kijowskiego do ustąpienia z funkcji szefa stowarzyszenia. Pomimo tego apelu i negatywnej kampanii wyborczej pod jego adresem, 28 stycznia 2017 został wybrany przewodniczącym Regionu Mazowsze KOD. Kandydował na szefa KOD, po czym 27 maja 2017, czyli w dniu wyborów wycofał swoją kandydaturę, a przewodniczącym KOD został wybrany Krzysztof Łoziński. Zjazd przyjął sprawozdanie Głównej Komisji Rewizyjnej, kierującej do Głównego Sądu Koleżeńskiego sprawę faktur Kijowskiego.
26 lipca 2017 Mateusz Kijowski, podobnie jak inni członkowie Zarządu Regionu Mazowsze Stowarzyszenia Komitet Obrony Demokracji, złożył rezygnację z pełnionych funkcji i wystąpił ze Stowarzyszenia. W 2018 zaangażował się w działalność Stowarzyszenia Wolność Równość Demokracja. Następnie zaczął pracować jako fryzjer.