Historia Szpital powstał 7 listopada 1947 jako placówka Wojewódzkiego Urzędu Bezpieczeństwa PublicznegoEncyklopedia Bydgoszczy, t. 5. Medycyna. praca zbiorowa pod red. Włodzimierza Jastrzębskiego. Towarzystwo Miłośników Miasta Bydgoszczy. Bydgoszcz 2011. , s. 125. Początkowo składał się z budynku przy ul. Markwarta 6 i dwóch pięter sąsiedniego budynku przy ul. Markwarta 4. Szpital posiadał wówczas 88 łóżekBoguszyński Mieczysław: Od warsztatu balwierskiego do szpitala klinicznego. Towarzystwo Miłośników Miasta Bydgoszczy. Bydgoszcz 2008. . Składał się z oddziałów: chirurgicznego, ginekologiczno-położniczego, skórno-wenerologicznego i wewnętrznego. W 1962 r. w miejsce oddziału skórno-wenerologicznego powołano oddział neurologiczny. W latach 1966-1967 wybudowano łącznik między budynkami Markwarta 4 i 6. W 1973 r. szpital jako pierwszy spośród placówek podległych Ministerstwu Spraw Wewnętrznych pozyskał oddział Intensywnej Opieki Medycznej. W 1975 r. z oddziału chirurgicznego powstał ortopedyczny (do 2000), natomiast w 1993 r. powołano oddział ginekologiczny. Po rozbudowie pod koniec lat 80. szpital liczył 127 łóżek.
Szpital zapewniał opiekę medyczną nad pracownikami resortu MSW (policja), uwzględniając specyfikę potrzeb zdrowotnych tej grupy zawodowej. Po 1990 r. świadczy usługi wszystkim pacjentom, bez ograniczeń zawodowych.