Okres powojenny Tradycje NBTL reaktywowano z końcem 1945 roku z inicjatywy dr. Stefana Świąteckiego. Grupa ocalałych lekarzy bydgoskich powołała w tym roku Bydgoskie Towarzystwo LekarskieMrozek Zdzisław: Towarzystwo Lekarskie w Bydgoszczy (1945-1955) [w:] Kalendarz Bydgoski 1984. 20 sierpnia 1946 r. towarzystwo zorganizowało Ogólnopolski Zjazd Lekarzy z okazji obchodów 600-lecia Bydgoszczy, połączonych z Pomorską Wystawą Gospodarczą.
Celem Towarzystwa było pogłębienie wiedzy lekarskiej, informowanie o bieżących osiągnięciach naukowych oraz referowanie ciekawszych publikacji naukowych. Na zebraniach wygłaszano referaty, których autorzy – pracownicy naukowi akademii medycznych w Gdańsku i Poznaniu, dzielili się swoimi wynikami badań. Towarzystwo prowadziło również akcję oświatową dla społeczeństwa miasta Bydgoszczy oraz gromadziło bibliotekę, która w 1951 r. obejmowała 3,5 tys., a w 1954 r. – 8,8 tys. woluminów. W 1953 r. przy ul. Gdańskiej 46 powstał w Bydgoszczy oddział Głównej Biblioteki Lekarskiej, przekształcony w 1984 r. w bibliotekę Akademii Medycznej w Bydgoszczy.